- Код статьи
- 10.31857/S0026365624010025-1
- DOI
- 10.31857/S0026365624010025
- Тип публикации
- Статья
- Статус публикации
- Опубликовано
- Авторы
- Том/ Выпуск
- Том 93 / Номер выпуска 1
- Страницы
- 17-24
- Аннотация
- В клеточных стенках типовых штаммов двух видов фитопатогенных бактерий — Clavibacter insidiosus ВКМ Ас-1402Ти Clavibacter nebraskensis ВКМ Ас-1404Т(семейство Microbacteriaceae, класс Actinomycetes) — обнаружено по два гликополимера разных типов. Первый тип представлен новыми, не описанными ранее (1→6)-связанными β-D-галактофурананами, отличающимися у двух изученных штаммов структурой боковых олигосахаридных цепочек. Второй гликополимер, пируватсодержащий галактоманнан, был идентичен у обоих штаммов. Полученные в настоящей работе результаты, в совокупности с ранее опубликованными, указывают на то, что наличие в клеточных стенках пируватсодержащего галактоманнана и (1→6)-связанных β-D-галактофурананов (с одинаковой структурой кора и различными олигосахаридными боковыми заместителями) можно рассматривать в качестве хемотаксономического признака рода Clavibacter, в то время как ди-, три- или тетрасахаридные заместители в галактофурананах (отличающиеся по структуре и компонентному составу) специфичны для видов или групп видов. Полученные данные расширяют представления о структурном разнообразии природных гликополимеров и особенностях строения клеточных стенок бактерий различных таксонов и могут представлять интерес для таксономических исследований и работ по выяснению молекулярных механизмов взаимодействия бактерий с клетками растений.
- Ключевые слова
- Clavibacter галактофуранан галактоманнан клеточная стенка хемотаксономия
- Дата публикации
- 15.01.2024
- Год выхода
- 2024
- Всего подписок
- 0
- Всего просмотров
- 33
Библиография
- 1. Тульская Е. М., Шашков А. С., Стрешинская Г. М., Сенченкова С. Н., Потехина Н. В., Козлова Ю. И., Евтушенко Л. И. Тейхуроновые и тейхулозоновые кислоты актиномицетов // Биохимия. 2011. Т. 76. С. 904–913. Tul’skaya E. M., Shashkov A. S., Streshinskayа G. M., Senchenkova S. N., Potekhina N. V., Kozlova Yu.I., Evtushenko L. I. Teichuronic and teichulosonic acids of actinomycetes // Biochemistry (Moscow). 2011. V. 76. P. 736–744. https://doi.org/10.1134/S0006297911070030
- 2. Шашков А. С., Тульская Е. М., Стрешинская Г. М., Дмитренок А. С., Потехина Н. В., Сенченкова С. Н., Пискункова Н. Ф., Дорофеева Л. В., Евтушенко Л. И. Рамноманнаны и тейхуроновая кислота из клеточной стенки Rathayibacter tritici ВКМ Ас-1603Т // Биохимия. 2020. Т. 85. С. 428–437. Shashkov A. S., Tul’skaya E.M., Streshinskaya G. M., Dmitrenok A. S., Potekhina N. V., Senchenkova S. N., Piskunkova N. F., Dorofeeva L. V., Evtushenko L. I. Rhamnomannans and teichuronic acid from cell wall of Rathayibacter tritici VKM Ac-1603T // Biochemistry (Moscow). 2020. V. 85. P. 369–377. https://doi.org/10.1134/S0006297920030128
- 3. Altona C., Haasnoot C. A. G. Prediction of anti and gauche vicinal proton-proton coupling constants in carbohydrates: a simple additivity rule for pyranose rings // Org. Magn. Reson. 1980. V. 13. P. 417–429. https://doi.org/10.1002/mrc.1270130606
- 4. Angyal S. J. Hudson’s rules of isorotation as applied to furanosides, and the conformations of methyl aldofuranosides // Carbohydr. Res. 1979. V. 77. P. 37–50. https://doi.org/10.1016/S0008-6215 (00)83791-X
- 5. Bock K., Pedersen C. Carbon-13 nuclear magnetic resonance spectroscopy of monosaccharides // Adv. Carbohydr. Chem. Biochem. 1983. V. 41. P. 27–66. https://doi.org/10.1016/S0065-2318 (08)60055-4
- 6. Brown S., Santa Maria J. P. Jr., Walker S. Wall teichoic acids of gram-positive bacteria // Annu. Rev. Microbiol. 2013. V. 67. P. 313‒336. https://doi.org/10.1146/annurev-micro-092412155620
- 7. Chun J., Oren A., Ventosa A., Christensen H., Arahal D. R., da Costa M. S., Rooney A. P., Yi H., Xu X. W., De Meyer S., Trujillo M. E. Proposed minimal standards for the use of genome data for the taxonomy of prokaryotes // Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2018. V. 68. P. 461–466. https://doi.org/10.1099/ijsem.0.002516
- 8. Cummins C. S. La composition chimique des parois cellulaires d’ actinomycetes et son application taxonomique // Ann. Inst. Pasteur. 1962. V. 103. P. 385–391.
- 9. Davis M. J., Graves Gillaspie A. Jr., Vidaver A. M., Harris R. W. Clavibacter: a new genus containing some phytopathogenic coryneform bacteria, including Clavibacter xyli subsp. xyli sp. nov., subsp. nov. and Clavibacter xyli subsp. cynodontis subsp. nov., pathogens that cause ratoon stunting disease of sugarcane and bermudagrass stunting disease // Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 1984. V. 34. P. 107‒117. https://doi.org/10.1099/00207713-34-2-107
- 10. Evtushenko L. I., Ariskina E. V. Nocardioidaceae // Bergey’s Manual of Systematics of Archaea and Bacteria / Ed. Whitman W. B. 2015. P. 1–18. https://doi.org/10.1002/9781118960608.fbm00042
- 11. Guérin H., Kulakauskas S., Chapot-Chartier M. P. Structural variations and roles of rhamnose-rich cell wall polysaccharides in Gram-positive bacteria // J. Biol. Chem. 2022. V. 298. Art. 102488. https://doi.org/10.1016/j.jbc.2022.102488
- 12. Goodfellow M., Jones A. L. Order V. Corynebacteriales ord. nov. // Bergey’s Mannual of Systematic Bacteriology. 2nd edn. / Eds. Whitmann W., Goodfellow M., Kämpfer P., Busse H.-J., Trujillo M., Ludwig W., Suzuki K. New York‒Dordrecht‒Heidelberg‒London: Springer, 2012. V. 5. P. 1‒14. https://doi.org/10.1002/9781118960608.obm00009
- 13. Eichenlaub R., Gartemann K.-H. The Clavibacter michiganensis subspecies: molecular investigation of gram-positive bacterial plant pathogens // Annu. Rev. Phytopathol. 2011. V. 49. P. 445–464. https://doi.org/10.1146/annurev-phyto-072910-095258
- 14. Janson P.-E., Kenne L., Widmalm G. Computer-assisted structural analysis of polysaccharides with an extended version of CASPER using 1H- and 13C-n. m. r. data // Carbohydr. Res. 1989. V. 188. P. 169–191. https://doi.org/10.1016/0008-6215 (89)84069-8
- 15. Kim D., Shashkov A. S., Dmitrenok A. S., Potekhina N. V., Senchenkova S. N., Dorofeeva L. V., Evtushenko L. I., Tul’skaya E. M. Novel galactofuranan and pyruvylated galactomannan in the cell wall of Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis VKM Ac-1403T // Carbohydr. Res. 2021. V. 500. Art. 108247. https://doi.org/10.1016/j.carres.2021.108247
- 16. Lechevalier M. P., Lechevalier H. Chemical composition as a criterion in the classification of aerobic actinomycetes // Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 1970. V. 20. P. 435‒443.
- 17. Nouioui I., Carro L., Garcia-Lopez M., Meier-Kolthoff J.P., Woyke T., Kyrpides N. C., Pukall R., Klenk H. P., Goodfellow M., Goker M. Genome-based taxonomic classification of the phylum Actinobacteria // Front. Microbiol. 2018. V. 9. Art. 2007. https://doi.org/10.3389/fmicb.2018.02007
- 18. Perepelov A. V., Shashkov A. S., Kim D., Potekhina N. V., Dmitrenok A. S., Senchenkova S. N., Dorofeeva L. V., Evtushenko L. I., Tul’skaya E.M. A highly branched novel galactofuranan in the cell wall of Clavibacter tesselarius VKM Ac-1406T // Carbohydr. Res. 2023a. V. 529. Art. 108823. https://doi.org/10.1016/j.carres.2023.108823
- 19. Perepelov A. V., Kim D., Tul’skaya E.M., Potekhina N. V., Dmitrenok A. S., Senchenkova S. N., Dorofeeva L. V., Evtushenko L. I., Shashkov A. S. A novel cell wall galactofuranan in Clavibacter phaseoli VKM Ac-2641T // Carbohydr. Res. 2023b. V. 525. P. 108778. https://doi.org/10.1016/j.carres.2023.108778
- 20. Potekhina N. V., Streshinskaya G. M., Tul’skaya E.M., Shashkov A. S. Cell wall teichoic acids in the taxonomy and characterization of Gram-positive bacteria // Taxonomy of Prokaryotes. Methods in Microbiology / Eds. Rainey F. A., Oren A. London: Academic Press, 2011. V. 38. Ch. 6. P. 132–164. https://doi.org/10.1016/B978-0-12-387730-7.00006-1
- 21. Saddler G. D., Kerr E. M. “Genus V. Clavibacter Davis, Gillaspie, Vidaver and Harris 1984” // Bergey’s Mannual of Systematic Bacteriology. 2nd edn. // Eds. Whitmann W., Goodfellow M., Kämpfer P., Busse H.-J., Trujillo M., Ludwig W., Suzuki K. New York‒Dordrecht‒Heidelberg‒London: Springer, 2012. V. 5. P. 877–883.
- 22. Schade J., Weidenmaier C. Cell wall glycopolymers of Firmicutes and their role as nonprotein adhesins // FEBS Lett. 2016. V. 590. P. 3758–3771. https://doi.org/10.1002/1873-3468.12288
- 23. Shashkov A. S., Potekhina N. V., Kim D., Dmitrenok A. S., Senchenkova S. N., Dorofeeva L.V, Evtushenko L. I., Tul’skaya E. M. Cell wall galactofuranan and pyruvate-containing galactomannan in the cell walls of Clavibacter strains // Carbohydr. Res. 2021. V. 510. Art. 108435. https://doi.org/10.1016/j.carres.2021.108435
- 24. Starodumova I., Prisyazhnaya N, Tarlachkov S., Dorofeeva L., Vasilenko O., Evtushenko L. Taxonomy of the genus Clavibacter // XXXVII Annual Meeting of the European Culture Collections’ Organisation Conference Proceedings. Moscow: Maks-Press, 2018. P. 107.
- 25. Syr N., Perlin A. S. The conformations of furanosides. A 13C nuclear magnetic resonance study // Can. J. Chem. V. 57. 1979. P. 2504–2511. https://doi.org/10.1139/ v79-399
- 26. Takeuchi M., Yokota A., Misaki A. Comparative structures of the cell-wall polysaccharides of four species of the genus Microbacterium // J. Gen. Appl. Microbiol. 1990. V. 36. P. 255–271.
