- Код статьи
- 10.31857/S0026365624040062-1
- DOI
- 10.31857/S0026365624040062
- Тип публикации
- Статус публикации
- Опубликовано
- Авторы
- Том/ Выпуск
- Том 93 / Номер выпуска 4
- Страницы
- 438-443
- Аннотация
- Фосфонаты являются альтернативным источником фосфора для бактерий. Геном Achromobacter insolitus LCu2 содержит три предсказанных кластера phn транспортеров АВС-типа-переносчиков фосфонатов в клетку. Чтобы понять функциональную, эволюционную и экологическую роль phn кластеров, мы провели филогенетический анализ субстрат-связывающих PhnD белков штамма LCu2 с гомологами других видов рода Achromobacter и близкородственных родов семейства Alcaligenaceae. PhnD транспортеры образовывали три отдельных кластера, что свидетельствует о различии в их структурном строении. PhnD1 и PhnD2 у Achromobacter присутствовали в геномах всех видов, группировались в основном отдельно от других представителей Alcaligenaceae, что говорит о вертикальном наследовании генов phnD1 и phnD2 и их участии в процессах жизнеобеспечения. PhnD3 найден в геномах у семи видов рода Achromobacter. Возможно, ген phnD3 приобретен в процессе горизонтального переноса или дупликации и индуцируется при адаптации к изменяющимся условиям обитания. Поддержание трех структурно разных кластеров phn транспортеров, по-видимому, обеспечивает A. insolitus LCu2 экологическое преимущество, путем извлечения фосфора не только из фосфонатов, но и других фосфорорганических соединений.
- Ключевые слова
- фосфонаты phn транспортеры Achromobacter insolitus филогения Alcaligenaceae
- Дата публикации
- 15.07.2024
- Год выхода
- 2024
- Всего подписок
- 0
- Всего просмотров
- 26
Библиография
- 1. Amstrup S. K., Ong S. C., Sofos N., Karlsen J. L., Skjerning R. B., Boesen T., Enghold J. J., Hove-Jensen B., Brodersen D. E. Structural remodelling of the carbon–phosphorus lyase machinery by a dual ABC ATPase // Nat. Commun. 2023. V. 14. Art. 1001. https://doi.org/10.1038/s41467-023-36604-y
- 2. Hove-Jensen B., Zechel D. L., Jochimsen B. Utilization of glyphosate as phosphate source: biochemistry and genetics of bacterial carbon-phosphorus lyase // Microbiol. Mol. Biol. Rev. 2014. V. 78. P. 176‒197.
- 3. Kertesz M., Elgorriaga A., Amrhein N. Evidence for two distinct phosphonate-degrading enzymes (C‒P lyases) in Arthrobacter sp. GLP-1 // Biodegradation. 1991. V. 2. P. 53‒59.
- 4. Krol E., Becker A. Global transcriptional analysis of the phosphate starvation response in Sinorhizobium meliloti strains 1021 and 2011 // Mol. Genet. Genom. 2004. V. 272. P. 1‒17.
- 5. Kumar S., Stecher G., Li M., Knyaz C., Tamura K. MEGA X: Molecular Evolutionary Genetics Analysis across computing platforms // Mol. Biol. Evol. 2018. V. 35. P. 1547‒1549.
- 6. Shah B. S., Ford B. A., Varkey D., Mikolajek H., Orr C., Mykhaylyk V., Owens R. J., Paulsen I. T. Marine picocyanobacterial PhnD1 shows specificity for various phosphorus sources but likely represents a constitutive inorganic phosphate transporter // ISME J. 2023. V. 17. P. 1040‒1051.
- 7. Sievers F., Wilm A., Dineen D., Gibson T. J., Karplus K., Li W., Lopez R., McWilliam H., Remmert M., Söding J., Thompson J. D., Higgins D. G. Fast, scalable generation of high-quality protein multiple sequence alignments using Clustal Omega // Mol. Syst. Biol. 2011. V. 7. Art. 539.
- 8. Zavaleta-Pastor M., Sohlenkamp C., Gao J. L., Guan Z., Zaheer R., Finan T. M., Geiger O. Sinorhizobium meliloti phospholipase C required for lipid remodeling during phosphorus limitation // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2010. V. 107. P. 302‒307.
