By this author

<i>Desulfosporosinus shakirovi</i> sp. nov., a sulfate-reducing bacterium with ability to petroleum hydrocarbons degradation

Issue number 3 from 01.03.2025

Из донных отложений северной части Японского моря выделена новая сульфатвосстанавливающая бактерия (штамм SRJS8^Т), обладающая способностью к биодеградации углеводородов нефти. Изолят был представлен грамположительными подвижными одиночными спорообразующими палочками размером 0.4–0.5 × 2.0–5.0 мкм, рос в диапазоне температуры 6–30°С (оптимум 25°С), рН 6.3–7.7 (оптимум 7.3) и концентрации NaCl от 0 до 20 г/л (оптимум 2 г/л). Штамм SRJS8^Т использовал бутанол, глицерин, метанол, этанол, бутират, лактат, пируват, формиат, дрожжевой экстракт, Н₂/СО₂, сырую нефть в качестве доноров электронов и источника углерода в присутствии сульфата. В качестве акцепторов электронов штамм использовал сульфат, сульфит, тиосульфат, элементную серу, фумарат и Fe(III), но не нитрат, арсенат и ДМСО. Штамм SRJS8^Т был способен сбраживать лактат и пируват, но не дрожжевой экстракт в отсутствие сульфата. Ближайшим родственником штамма SRJS8^Т с 98.49% сходства последовательностей гена 16S рРНК является Desulfosporosinus lacus STP12^T. У штамма SRJS8^Т секвенирован геном размером 5.43 Mб. ДНК–ДНК гомология геномов штамма SRJS8^Т и D. lacus STP12^T составила 57.4%, а значение ANI – 93.69%. Содержание Г + Ц в ДНК – 42.08%. На основании полученных данных штамм SRJS8^Т (=VKM В-3489^Т =JCM 39189^Т) отнесен к новому виду рода Desulfosporosinus, для которого предложено название Desulfosporosinus shakirovi sp. nov.

2 0

Methanoculleus bovis sp. nov., a New Methane-Producing Hydrogen-Utilizing Archaea from the Rumen of a Cow

Issue number 6 from 01.06.2025

Из содержимого рубца коровы (Московская область, Россия) выделена новая метанообразующая архея — штамм 7T. Морфологически штамм представляет собой неподвижные кокковидные клетки неправильной формы размером 1.3—4.3 мкм и их небольшие агрегаты. В качестве энергетических субстратов для метаногенеза штамм использует исключительно смесь водорода и углекислоты и требует присутствия ацетата в среде культивирования. Клетки растут при температуре 20—53°С (оптимум 45°С), рН 6.5—7.8 (оптимум рН 7.2—7.4) и толерантны к содержанию NaCl до 0.34 М. По данным анализа последовательности гена 16S рРНК новый метаноген принадлежит к роду Methanoculleus, имея с ближайшим к нему видом этого рода M. bourgensis MS2 уровень сходства этого гена 98.16%. Среднее нуклеотидное сходство (ANI) между геномами штаммов 7T и M. bourgensis MS2 составило 88.24%, а виртуальная оценка гибридизации геномов этих двух штаммов составила 31.40%. Содержание Г + Ц геномной ДНК составляет 61.27% мол. %. На основании данных филогенетического анализа и физиолого-биохимических свойств изолята мы предлагаем отнести выделенный штамм 7T (= VKM B-3409 = JCM 39547) к новому виду Methanoculleus bovis sp. nov.

5 0