Из донных отложений северной части Японского моря выделена новая сульфатвосстанавливающая бактерия (штамм SRJS8Т), обладающая способностью к биодеградации углеводородов нефти. Изолят был представлен грамположительными подвижными одиночными спорообразующими палочками размером 0.4–0.5 × 2.0–5.0 мкм, рос в диапазоне температуры 6–30°С (оптимум 25°С), рН 6.3–7.7 (оптимум 7.3) и концентрации NaCl от 0 до 20 г/л (оптимум 2 г/л). Штамм SRJS8Т использовал бутанол, глицерин, метанол, этанол, бутират, лактат, пируват, формиат, дрожжевой экстракт, Н2/СО2, сырую нефть в качестве доноров электронов и источника углерода в присутствии сульфата. В качестве акцепторов электронов штамм использовал сульфат, сульфит, тиосульфат, элементную серу, фумарат и Fe(III), но не нитрат, арсенат и ДМСО. Штамм SRJS8Т был способен сбраживать лактат и пируват, но не дрожжевой экстракт в отсутствие сульфата. Ближайшим родственником штамма SRJS8Т с 98.49% сходства последовательностей гена 16S рРНК является Desulfosporosinus lacus STP12T. У штамма SRJS8Т секвенирован геном размером 5.43 Mб. ДНК–ДНК гомология геномов штамма SRJS8Т и D. lacus STP12T составила 57.4%, а значение ANI – 93.69%. Содержание Г + Ц в ДНК – 42.08%. На основании полученных данных штамм SRJS8Т (=VKM В-3489Т =JCM 39189Т) отнесен к новому виду рода Desulfosporosinus, для которого предложено название Desulfosporosinus shakirovi sp. nov.
Индексирование
Scopus
Crossref
Высшая аттестационная комиссия
При Министерстве образования и науки Российской Федерации