Статьи автора

<i>Sulfurospirillum Tamanensis</i> sp. nov. – факультативно анаэробная алкалифильная бактерия из наземного грязевого вулкана

Номер выпуска 1 от 01.01.2023

Из наземного грязевого вулкана Таманского полуострова выделена алкалифильная факультативно анаэробная бактерия (штамм T05b^T). Клетки изолята представляют собой подвижные спириллы толщиной 0.5 мкм и длиной 1.5–2.5 мкм. Штамм T05b^T растет при температуре 6–42°C (оптимум ‒ 30°C), pH 8.0–11.0 (оптимум ‒ 9.0), концентрации NaCl 0–14% (вес/об.); использует лактат, формиат, малат, пируват, молекулярный водород, элементную серу, сульфит, тиосульфат и сульфид в качестве донора электронов и нитрат, фумарат, элементную серу, сульфит, тиосульфат, ДМСО, арсенат и кислород в качестве акцептора электронов. Продуктом восстановления нитрата является аммоний. Сбраживает малат, пируват, фумарат. Способен к микроаэробному (до 3% О₂, об./об.) росту. Штамм T05b^T не использует сульфат и Fe(III) в качестве акцептора электронов, не диспропорционирует элементную серу, тиосульфат и сульфит и не сбраживает глюкозу, фруктозу, сахарозу, лактат, формиат, малеинат, дрожжевой экстракт и пептон. В жирнокислотном составе клеток преобладают C16:1 ω7 (45.9%), C16:0 (25.8%) и C18:1 ω7 (20.9%). Геном штамма T05b^T имеет размер 2.46 Мп и содержание Г + Ц 45.5%. В геноме содержатся гены, кодирующие ферменты энергетического метаболизма: периплазматический комплекс нитратредуктазы Nap, тиосульфат/полисульфид редуктазу Phs/Psr, сульфид:хинон оксидоредуктазу Sqr и дыхательную арсенатредуктазу Arr. Анализ нуклеотидной последовательности гена 16S рРНК штамма T05b^T показал 98.61% сходства с типовым штаммом Sulfurospirillum alkalitolerans (филум “Campylobacterota”). На основании фенотипических характеристик и данных филогенетического анализа предлагается отнести данный изолят к новому виду рода Sulfurospirillum, как Sulfurospirillum tamanensis sp. nov. с типовым штаммом T05b^T (=DSM 112596^T = VKM B-3538^T).

27 0

<i>DESULFOBOTULUS PELOPHILUS</i> SP. NOV. – алкалифильная сульфатвосстанавливающая бактерия из наземного грязевого вулкана

Номер выпуска 4 от 01.07.2023

Алкалифильная сульфатвосстанавливающая анаэробная бактерия (штамм Н1^T) была выделена из наземного грязевого вулкана Таманского полуострова. Клетки изолята представляют собой грамотрицательные подвижные вибрионы толщиной 1 мкм и длиной 2.0–2.5 мкм. Штамм Н1^T растет при температуре 14–42°C (оптимум 37°C), pH 8.5–10.5 (оптимум 9.5) и концентрации NaCl 0.5–6% (вес/об.) (оптимум 0.5–1.5%); использует пируват, лактат, бутират, капроат, каприлат и пеларгонат в качестве донора электронов и элементную серу, сульфит и сульфат в качестве акцептора электронов. Сбраживает пируват и лактат. Не способен к росту в присутствии кислорода. Штамм H1^T не использует тиосульфат, ДМСО, фумарат, нитрат, нитрит, арсенат, селенит и Fe(III) в качестве акцептора электронов, не диспропорционирует элементную серу, тиосульфат и сульфит и не сбраживает глюкозу, фруктозу, сахарозу, трегалозу, галактозу, ксилозу, фумарат, цитрат, дрожжевой экстракт и пептон. В жирнокислотном составе клеток преобладают C_20:0 (54.2%), C_22:0 (24.6%) и C_18:0 (11.1%). Геном штамма Н1^T имеет размер 3.66 Мп и содержание Г + Ц 51.1%. В геноме содержатся гены, кодирующие ферменты диссимиляционной сульфатредукции и β-окисления жирных кислот. По результатам анализа гена 16S рРНК ближайшим родственным микроорганизмом штамма Н1^Т является Desulfobotulus mexicanus (98.3% сходства). На основании фенотипических характеристик и данных филогенетического анализа предлагается отнести данный изолят к новому виду рода Desulfobotulus, как Desulfobotulus pelophilus sp. nov. с типовым штаммом H1^T (=DSM 112796^T = VKM B-3697^Т =UQM 41590^T).

28 0