By this author

A New Methanogenic, Hydrogenotrophic Archaeon from Spitsbergen Permafrost

Issue number 2 from 01.03.2023

Из образца многолетнемерзлых отложений о. Западный Шпицберген выделен новый штамм метанобразующих архей, названный нами VT^T. Клетки штамма представлены изогнутыми неподвижными палочками размером 2.7‒5.3 × 0.3 мкм. Оптимальными условиями для роста были температура 20°C, pH 6.6, содержание NaCl 0.03‒0.05 M. Единственным используемым субстратом являлась газовая смесь H₂/CO₂. В присутствии H₂/CO₂ рост стимулировался добавлением дрожжевого экстракта и жидкости рубца. По результатам филогенетического анализа последовательностей гена 16S рРНК штамм VT^T отнесен к роду Methanobacterium с ближайшим родственником M. lacus 17A1^T (сходство 97.02%). Сравнение секвенированного и собранного генома штамма VT^T с геномами других видов рода подтвердило эти данные, а также показало их отличия на видовом уровне. По результатам проведенных исследований мы полагаем, что выделенный нами метаноген является представителем нового вида метанообразующих архей, для которого предложено название Methanobacterium spitsbergensе sp. nov. с типовым штаммом VT^T (=VKM B-3566^T = JCM 39284^T).

52 0

<i>Methanosarcina baikalica</i> sp. nov., a new methanogenic archaea isolated from surface bottom sediments of Lake Baikal

Issue number 6 from 15.11.2024

Из донных осадков пресноводного озера Байкал (Восточная Сибирь, Россия) выделена новая метанобразующая архея штамм Z-7115^T . Морфологически штамм представляет неподвижные кокковидные клетки 0.5–3 мкм, собранные по 2–4 в пакеты и их небольшие агрегаты. В качестве энергетических субстратов для метаногенеза штамм использует метанол, моно-, ди-, триметиламин и ацетат. Клетки растут при температуре 15–35°С (оптимум 25°С), рН 6.3–7.5 (оптимум рН 7.3) и толерантны к концентрации NaCl < 0.1 М. Содержание Г + Ц геномной ДНК – 40.76 мол. %. По данным анализа гена 16S рРНК новый изолят принадлежит к роду Methanosarcina, имея с ближайшим к нему видом этого рода M. siciliae T4/M^Т уровень сходства этого гена 98.51%. Cреднее нуклеотидное сходство (ANI) между геномами штаммов Z-7115^Т и M. siciliae T4/M^Т составило 83.8%. Виртуальная оценка гибридизации геномов этих двух штаммов составила 23.3%. На основании данных филогененетического анализа и морфо-физиологических свойств предлагается отнести выделенный штамм Z-7115^T (=JCM 39438, =VKM B-3565) к новому виду Methanosarcina baikalica sp. nov.

60 0