Статьи автора

Структура и сезонная вариабельность микробных сообществ грунтовых вод города Москва

Номер выпуска 2 от 01.03.2023

Важным экологически значимым элементом водной экосистемы, чувствительным к изменениям условий окружающей среды, являются подземные воды, выходящие на поверхность в виде родников. Связанное с урбанизацией антропогенное воздействие ведет к изменению характеристик грунтовых вод, что, в свою очередь, влияет на состав микробных сообществ вод родников. С помощью высокопроизводительного секвенирования фрагментов генов 16S рибосомной РНК мы охарактеризовали состав микробных сообществ пяти естественных родников на территории Москвы в весенний, летний и зимний сезоны. Микробные сообщества каждого из родников в разные сезоны были близки между собой и четко отличались от микробиомов других родников. Среди архей, составлявших в среднем около 20% микробных сообществ, преобладали аммоний-окисляющие Crenarchaeota, а также представители Nanoarchaeota. Большинство бактерий относилось к филумам Proteobacteria, Patescibacteria, Verrucomicrobiota, Chloroflexi и Bacteroidota. В родниках с предположительно более глубоким залеганием источника воды значительные доли в микробных сообществах составляли автотрофные бактерии, в том числе железоокисляющие бактерии семейства Gallionellaceae, нитрификаторы и метанотрофы. Химический и молекулярный анализы не выявили загрязнений вод родников токсичными веществами и нефтепродуктами, а также присутствия патогенных микроорганизмов и индикаторов фекального загрязнения. Однако в весенний сезон в микробиомах воды увеличивались доли галофильных и углеводород-окисляющих бактерий, что может отражать поступление в подземные воды после таяния снега антигололедных реагентов и нефтепродуктов, которые успешно биодеградируются в почве.

31 0

Метагеномный анализ осадков карстового меромиктического озера Черный Кичиер выявил большое количество некультивируемых Thermoplasmatota

Номер выпуска 2 от 15.03.2024

Проведены исследования микробного сообщества донных осадков карстового озера Черный Кичиер. Осадки характеризовались высоким содержанием сероводорода, растворенного метана, а также органического вещества. Прямые измерения с применением радиоизотопов показали высокую интенсивность микробных процессов деструкции органического вещества. В микробном сообществе найдены некультивируемые археи филума Thermoplasmatota. Анализ метагенома выявил представителей пяти порядков — Methanomassiliicoccales, Thermoprofundales (первое название Marine Benthic Group D и DHVEG-1), DTX01, SG8-5 и Candidatus Gimiplasmatales (бывший UBA10834). Ранее считалось, что эти археи являются исключительно обитателями крайне бедных органическим веществом глубинных морских осадков. Такая находка меняет представление о роли архей пяти порядков филума Thermoplasmatota в деструкционном сегменте цикла углерода.

29 0