Статьи автора

Филогенетический анализ <i>phn</i> транспортеров <i>Achromobacter insolitus</i> LCu2

Номер выпуска 4 от 15.07.2024

Фосфонаты являются альтернативным источником фосфора для бактерий. Геном Achromobacter insolitus LCu2 содержит три предсказанных кластера phn транспортеров АВС-типа-переносчиков фосфонатов в клетку. Чтобы понять функциональную, эволюционную и экологическую роль phn кластеров, мы провели филогенетический анализ субстрат-связывающих PhnD белков штамма LCu2 с гомологами других видов рода Achromobacter и близкородственных родов семейства Alcaligenaceae. PhnD транспортеры образовывали три отдельных кластера, что свидетельствует о различии в их структурном строении. PhnD₁ и PhnD₂ у Achromobacter присутствовали в геномах всех видов, группировались в основном отдельно от других представителей Alcaligenaceae, что говорит о вертикальном наследовании генов phnD₁ и phnD₂ и их участии в процессах жизнеобеспечения. PhnD₃ найден в геномах у семи видов рода Achromobacter. Возможно, ген phnD₃ приобретен в процессе горизонтального переноса или дупликации и индуцируется при адаптации к изменяющимся условиям обитания. Поддержание трех структурно разных кластеров phn транспортеров, по-видимому, обеспечивает A. insolitus LCu2 экологическое преимущество, путем извлечения фосфора не только из фосфонатов, но и других фосфорорганических соединений.

25 0

Деградация коричной кислоты ризосферным штаммом <i>Achromobacter insolitus</i> LCu2

Номер выпуска 5 от 15.09.2024

Штамм Achromobacter insolitus LCu2, изолированный с корней люцерны посевной (Medicago sativa L.), утилизировал коричную кислоту, а также ее метокси-производные ‒ ванилиновую и феруловую кислоты – в качестве единственного источника углерода. Слабый рост был отмечен на м-кумаровой, но не на о- и п-кумаровых кислотах. Рост на коричной кислоте был медленным и диауксичным. Убыль субстрата из среды культивирования составила 53%, деструктивная эффективность – 30 мкг/мг сырой биомассы в течение 14 сут. Несмотря на бактерицидное действие коричной кислоты, культура A. insolitus LCu2 длительное время сохраняла жизнеспособность. Геномный анализ позволил выявить два генных кластера hca и mhp, отвечающих за дигидроксилирование фенильного кольца (hcaA1A2CDB) и его последующее расщепление до продуктов центрального метаболизма (mhpACDE), а также транскрипционный регулятор (hcaR) и предполагаемый транспортер (hcaT). Предположительный биохимический путь деградации коричной кислоты штаммом A. insolitus LCu2 был предсказан с использованием геномных данных.

30 0