By this author

Determination of the gut microbiota composition of common noctule by bacteriological analysis and high-throughput sequencing of 16S rRNA

Issue number 6 from 15.11.2024

Рукокрылые (Chiroptera) являются вторым по видовому разнообразию отрядом млекопитающих после грызунов, что обеспечивает их ключевую роль в функционировании экосистем. Микробиота рукокрылых, особенно бактериальная, является мало изученной, что не позволяет точно оценить роль летучих мышей в микробной экологии. В ходе этого исследования мы определили состав и разнообразие кишечной микробиоты рыжих вечерниц (Nyctalus noctula) г. Ростова-на-Дону методами бактериологического анализа и высокопроизводительного секвенирования V3‒V4 фрагментов гена 16S рРНК. В результате обнаружено, что микробное разнообразие, определяемое при помощи высокопроизводительного секвенирования 16S рРНК, статистически значимо выше (p < 0.001) в сравнении с бактериологическим методом. Однако масс-спектрометрическая идентификация бактериальных изолятов позволила определить их видовую принадлежность, в то время как чувствительность использованного протокола секвенирования 16S рРНК ограничена достоверной идентификацией бактерий до ранга родов. Также бактерии родов Enterococcus, Citrobacter, Enterobacter, Lactococcus и Latilactobacillus явились наиболее превалентными в составе кишечной микробиоты рыжей вечерницы. Наше исследование предоставляет первые данные о составе культивируемой и некультивируемой микробиоты рыжей вечерницы, что является фундаментальным этапом в изучении особенностей микробиоты синантропных летучих мышей.

29 0